Инструмент для лабораторий · работает онлайн
qPioneer
Анализ qPCR в браузере — от планшета до отчёта.
Открытое веб-приложение (Python, Streamlit, Plotly) для анализа qPCR на 96- и 384-луночных планшетах.
Лицензия MIT
Возможности
Что умеет
Загрузка данных
Файлы TXT, CSV и XLSX с планшетов на 96 и 384 лунки.
Разметка планшета
Гены, условия и повторы отмечаются прямо на схеме планшета.
Контроль качества
Поиск выбросов среди технических повторов.
ΔCt и экспрессия
Нормализация по референсному гену и относительная экспрессия 2^−ΔCt.
Статистика
t-тесты между условиями с поправкой Бонферрони.
Интерактивные графики
Диаграммы размаха и столбчатые диаграммы с отметками значимости.
Экспорт
CSV, JSON, Excel и PNG, полный отчёт в PDF и HTML.
Ваши данные
Файлы остаются у вас
Файлы обрабатываются в памяти и не сохраняются на сервере. Сессию можно сохранить файлом и продолжить позже. Есть пример данных — можно попробовать без своих.
Часть qPCR-анализа для исследования, на котором стоит первый выпуск, я делал в qPioneer, часть — в R.